申请大棚养殖补贴需要准备以下手续和证件：
养殖备案登记
养殖户需要向当地的农业行政主管部门进行备案登记，提供包括个人姓名、住址、养殖场详细位置、规模以及养殖动物种类等信息。
备案登记通常需要15个工作日进行审核并发放备案证，没有备案登记证将无法申请补贴。
动物防疫合格证
养殖户必须向当地的兽医管理部门申请动物防疫合格证，内容包括动物饲养场地、隔离措施、无害化处理措施及养殖场的具体布局等信息。
该证件的缺失会导致罚款等惩处，并且无法享受相关的农业补贴政策。
养殖档案
养殖档案是养殖活动中不可或缺的一部分，包括畜禽品种、数量、种苗来源及进出栏记录、饲料药物使用情况等。
法律法规要求养殖户必须依法建立专项的养殖档案，缺失档案将导致无法申请补贴并受到处罚。
其他可能需要的证件
根据当地政策和具体项目要求，可能还需要提供其他相关证件，如工商营业执照、环保验收报告等。
建议：
养殖户在申请补贴前，应仔细了解当地政策和要求，确保所有证件齐全且符合标准。
及时与当地政府部门和兽医管理部门沟通，确保申请流程顺利进行。
注意项目申报通知，按时提交申请，以提高获得补贴的几率。
