公司登记申请应当去 工商行政管理局进行。具体来说，新创立的公司通常在国家工商行政管理局进行注册申请，而各级公司登记机关则需要在上级公司登记机关的指导和领导之下从事相关的公司登记事务。此外，根据《中华人民共和国公司法》和《工商登记管理条例》，公司登记机关负责不同范围内的公司登记工作，包括城市、县级、直辖市分局及区分局。股份有限公司通常由设区的市（地区）工商行政管理局负责登记。
因此，无论是设立有限责任公司、股份有限公司还是其他类型的公司，都应前往公司所在地的工商行政管理局进行登记注册。在办理注册公司的过程中，需要提交一系列的材料，包括公司章程、股东名单、董事及监事任命书等，以证明公司的合法性和合规性。
